Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Spc24Q9D083 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms