Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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