Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Exo5Q9CXP9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Exo5Q9CXP9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Exo5Q9CXP9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Exo5Q9CXP9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Exo5Q9CXP9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms