Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms