Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pfdn1Q9CWM4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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