Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1lQ9CWB5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms