Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Fcf1Q9CTH6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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