Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms