Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms