Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Atp6v0e1Q9CQD8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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