Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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