Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms