Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prpf8Q99PV0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prpf8Q99PV0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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