Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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