Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Sf3b1Q99NB9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sf3b1Q99NB9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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