Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl3Q99N95 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms