Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Brms1Q99N20 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Brms1Q99N20 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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