Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac9Q99N13 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac9Q99N13 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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