Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrrtQ99MR6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms