Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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