Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf144aQ925F3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf144aQ925F3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf144aQ925F3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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