Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snx15Q91WE1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx15Q91WE1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms