Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hps3Q91VB4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps3Q91VB4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms