Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cdk8Q8R3L8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk8Q8R3L8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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