Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc12Q8R344 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms