Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms