Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hecw1Q8K4P8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hecw1Q8K4P8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms