Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms