Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo18Q8K2I9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo18Q8K2I9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxo18Q8K2I9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxo18Q8K2I9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fbxo18Q8K2I9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms