Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Znf628Q8CJ78 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Znf628Q8CJ78 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms