Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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