Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ephb1Q8CBF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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