Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo48Q8CAT8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms