Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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