Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dclre1bQ8C7W7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dclre1bQ8C7W7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms