Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc113Q8C5T8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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