Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms