Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Nek11Q8C0Q4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek11Q8C0Q4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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