Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Snx16Q8C080 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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