Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms