Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q8BGC1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms