Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms