Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms