Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChfrQ810L3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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ChfrQ810L3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChfrQ810L3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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