Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Lrfn4Q80XU8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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