Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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