Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ttc29Q80VM3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms