Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpp38Q80UU2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rpp38Q80UU2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpp38Q80UU2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpp38Q80UU2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpp38Q80UU2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpp38Q80UU2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpp38Q80UU2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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