Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms