Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NischQ80TM9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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